Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
V1ra8Q9EQ48 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
V1ra8Q9EQ48 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
V1ra8Q9EQ48 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
V1ra8Q9EQ48 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
V1ra8Q9EQ48 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
V1ra8Q9EQ48 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
V1ra8Q9EQ48 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
V1ra8Q9EQ48 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
V1ra8Q9EQ48 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
V1ra8Q9EQ48 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
V1ra8Q9EQ48 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
V1ra8Q9EQ48 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
V1ra8Q9EQ48 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
V1ra8Q9EQ48 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
V1ra8Q9EQ48 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
V1ra8Q9EQ48 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
V1ra8Q9EQ48 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
V1ra8Q9EQ48 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
V1ra8Q9EQ48 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
V1ra8Q9EQ48 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
V1ra8Q9EQ48 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
V1ra8Q9EQ48 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
V1ra8Q9EQ48 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms