Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cmtr1Q9DBC3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cmtr1Q9DBC3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cmtr1Q9DBC3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cmtr1Q9DBC3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cmtr1Q9DBC3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cmtr1Q9DBC3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cmtr1Q9DBC3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cmtr1Q9DBC3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cmtr1Q9DBC3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cmtr1Q9DBC3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cmtr1Q9DBC3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cmtr1Q9DBC3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cmtr1Q9DBC3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Cmtr1Q9DBC3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cmtr1Q9DBC3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cmtr1Q9DBC3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cmtr1Q9DBC3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cmtr1Q9DBC3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cmtr1Q9DBC3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cmtr1Q9DBC3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cmtr1Q9DBC3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cmtr1Q9DBC3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cmtr1Q9DBC3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cmtr1Q9DBC3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cmtr1Q9DBC3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cmtr1Q9DBC3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cmtr1Q9DBC3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cmtr1Q9DBC3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cmtr1Q9DBC3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cmtr1Q9DBC3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cmtr1Q9DBC3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cmtr1Q9DBC3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cmtr1Q9DBC3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cmtr1Q9DBC3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cmtr1Q9DBC3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cmtr1Q9DBC3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cmtr1Q9DBC3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cmtr1Q9DBC3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cmtr1Q9DBC3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cmtr1Q9DBC3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cmtr1Q9DBC3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cmtr1Q9DBC3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cmtr1Q9DBC3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cmtr1Q9DBC3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cmtr1Q9DBC3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cmtr1Q9DBC3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cmtr1Q9DBC3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cmtr1Q9DBC3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cmtr1Q9DBC3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cmtr1Q9DBC3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cmtr1Q9DBC3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cmtr1Q9DBC3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cmtr1Q9DBC3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cmtr1Q9DBC3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cmtr1Q9DBC3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cmtr1Q9DBC3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cmtr1Q9DBC3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cmtr1Q9DBC3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cmtr1Q9DBC3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cmtr1Q9DBC3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cmtr1Q9DBC3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cmtr1Q9DBC3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cmtr1Q9DBC3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cmtr1Q9DBC3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cmtr1Q9DBC3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cmtr1Q9DBC3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cmtr1Q9DBC3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cmtr1Q9DBC3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cmtr1Q9DBC3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cmtr1Q9DBC3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cmtr1Q9DBC3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cmtr1Q9DBC3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cmtr1Q9DBC3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cmtr1Q9DBC3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cmtr1Q9DBC3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms