Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap1s2Q9DB50 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ap1s2Q9DB50 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ap1s2Q9DB50 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ap1s2Q9DB50 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ap1s2Q9DB50 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ap1s2Q9DB50 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ap1s2Q9DB50 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ap1s2Q9DB50 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ap1s2Q9DB50 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ap1s2Q9DB50 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ap1s2Q9DB50 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ap1s2Q9DB50 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ap1s2Q9DB50 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ap1s2Q9DB50 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ap1s2Q9DB50 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ap1s2Q9DB50 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ap1s2Q9DB50 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ap1s2Q9DB50 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ap1s2Q9DB50 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ap1s2Q9DB50 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap1s2Q9DB50 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap1s2Q9DB50 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap1s2Q9DB50 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap1s2Q9DB50 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap1s2Q9DB50 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap1s2Q9DB50 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap1s2Q9DB50 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap1s2Q9DB50 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap1s2Q9DB50 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap1s2Q9DB50 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap1s2Q9DB50 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap1s2Q9DB50 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap1s2Q9DB50 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap1s2Q9DB50 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap1s2Q9DB50 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ap1s2Q9DB50 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap1s2Q9DB50 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap1s2Q9DB50 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap1s2Q9DB50 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap1s2Q9DB50 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ap1s2Q9DB50 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ap1s2Q9DB50 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ap1s2Q9DB50 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ap1s2Q9DB50 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ap1s2Q9DB50 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms