Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smim23Q9DAL0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim23Q9DAL0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim23Q9DAL0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim23Q9DAL0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim23Q9DAL0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim23Q9DAL0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim23Q9DAL0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim23Q9DAL0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smim23Q9DAL0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim23Q9DAL0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim23Q9DAL0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim23Q9DAL0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim23Q9DAL0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim23Q9DAL0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim23Q9DAL0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim23Q9DAL0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smim23Q9DAL0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Smim23Q9DAL0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smim23Q9DAL0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Smim23Q9DAL0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smim23Q9DAL0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smim23Q9DAL0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smim23Q9DAL0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Smim23Q9DAL0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smim23Q9DAL0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Smim23Q9DAL0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smim23Q9DAL0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smim23Q9DAL0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smim23Q9DAL0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smim23Q9DAL0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smim23Q9DAL0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smim23Q9DAL0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Smim23Q9DAL0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smim23Q9DAL0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smim23Q9DAL0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smim23Q9DAL0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Smim23Q9DAL0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smim23Q9DAL0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Smim23Q9DAL0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smim23Q9DAL0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms