Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem239Q9DA47 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem239Q9DA47 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tmem239Q9DA47 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem239Q9DA47 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem239Q9DA47 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem239Q9DA47 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem239Q9DA47 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem239Q9DA47 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem239Q9DA47 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem239Q9DA47 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem239Q9DA47 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem239Q9DA47 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem239Q9DA47 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem239Q9DA47 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem239Q9DA47 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem239Q9DA47 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem239Q9DA47 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem239Q9DA47 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem239Q9DA47 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem239Q9DA47 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem239Q9DA47 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem239Q9DA47 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem239Q9DA47 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem239Q9DA47 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms