Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sgf29Q9DA08 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sgf29Q9DA08 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sgf29Q9DA08 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sgf29Q9DA08 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sgf29Q9DA08 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sgf29Q9DA08 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sgf29Q9DA08 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sgf29Q9DA08 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sgf29Q9DA08 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sgf29Q9DA08 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sgf29Q9DA08 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sgf29Q9DA08 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sgf29Q9DA08 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sgf29Q9DA08 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sgf29Q9DA08 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sgf29Q9DA08 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sgf29Q9DA08 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sgf29Q9DA08 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sgf29Q9DA08 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sgf29Q9DA08 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sgf29Q9DA08 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sgf29Q9DA08 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sgf29Q9DA08 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sgf29Q9DA08 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sgf29Q9DA08 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sgf29Q9DA08 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sgf29Q9DA08 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sgf29Q9DA08 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sgf29Q9DA08 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sgf29Q9DA08 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sgf29Q9DA08 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Sgf29Q9DA08 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sgf29Q9DA08 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sgf29Q9DA08 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sgf29Q9DA08 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sgf29Q9DA08 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sgf29Q9DA08 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sgf29Q9DA08 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sgf29Q9DA08 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sgf29Q9DA08 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sgf29Q9DA08 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Sgf29Q9DA08 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sgf29Q9DA08 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sgf29Q9DA08 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sgf29Q9DA08 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sgf29Q9DA08 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgf29Q9DA08 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgf29Q9DA08 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgf29Q9DA08 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sgf29Q9DA08 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sgf29Q9DA08 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sgf29Q9DA08 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sgf29Q9DA08 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sgf29Q9DA08 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sgf29Q9DA08 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sgf29Q9DA08 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sgf29Q9DA08 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sgf29Q9DA08 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sgf29Q9DA08 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgf29Q9DA08 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgf29Q9DA08 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgf29Q9DA08 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgf29Q9DA08 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgf29Q9DA08 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sgf29Q9DA08 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sgf29Q9DA08 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sgf29Q9DA08 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sgf29Q9DA08 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sgf29Q9DA08 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sgf29Q9DA08 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sgf29Q9DA08 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sgf29Q9DA08 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sgf29Q9DA08 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sgf29Q9DA08 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sgf29Q9DA08 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sgf29Q9DA08 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sgf29Q9DA08 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sgf29Q9DA08 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sgf29Q9DA08 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sgf29Q9DA08 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sgf29Q9DA08 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sgf29Q9DA08 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sgf29Q9DA08 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sgf29Q9DA08 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sgf29Q9DA08 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sgf29Q9DA08 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sgf29Q9DA08 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sgf29Q9DA08 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sgf29Q9DA08 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sgf29Q9DA08 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sgf29Q9DA08 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sgf29Q9DA08 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sgf29Q9DA08 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sgf29Q9DA08 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sgf29Q9DA08 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sgf29Q9DA08 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sgf29Q9DA08 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sgf29Q9DA08 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms