Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA04

Tmem89, Transmembrane protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem89Q9DA04 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem89Q9DA04 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem89Q9DA04 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem89Q9DA04 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem89Q9DA04 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem89Q9DA04 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem89Q9DA04 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem89Q9DA04 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem89Q9DA04 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem89Q9DA04 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem89Q9DA04 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem89Q9DA04 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem89Q9DA04 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem89Q9DA04 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem89Q9DA04 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms