Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J8

Bpifa3, BPI fold-containing family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa3Q9D9J8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bpifa3Q9D9J8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bpifa3Q9D9J8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bpifa3Q9D9J8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bpifa3Q9D9J8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bpifa3Q9D9J8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bpifa3Q9D9J8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bpifa3Q9D9J8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bpifa3Q9D9J8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bpifa3Q9D9J8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms