Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J8

Bpifa3, BPI fold-containing family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa3Q9D9J8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bpifa3Q9D9J8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bpifa3Q9D9J8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bpifa3Q9D9J8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bpifa3Q9D9J8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Bpifa3Q9D9J8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bpifa3Q9D9J8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bpifa3Q9D9J8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bpifa3Q9D9J8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Bpifa3Q9D9J8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bpifa3Q9D9J8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bpifa3Q9D9J8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bpifa3Q9D9J8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bpifa3Q9D9J8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bpifa3Q9D9J8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms