Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Q9D9H8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Q9D9H8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Q9D9H8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Q9D9H8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Q9D9H8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Q9D9H8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Q9D9H8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Q9D9H8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Q9D9H8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Q9D9H8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Q9D9H8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Q9D9H8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Q9D9H8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Q9D9H8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Q9D9H8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Q9D9H8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Q9D9H8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Q9D9H8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Q9D9H8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Q9D9H8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Q9D9H8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Q9D9H8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Q9D9H8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Q9D9H8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Q9D9H8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Q9D9H8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Q9D9H8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Q9D9H8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Q9D9H8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Q9D9H8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Q9D9H8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Q9D9H8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Q9D9H8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Q9D9H8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Q9D9H8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Q9D9H8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Q9D9H8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Q9D9H8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Q9D9H8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Q9D9H8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Q9D9H8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Q9D9H8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Q9D9H8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Q9D9H8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Q9D9H8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Q9D9H8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.76■■■■□ 3
Q9D9H8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Q9D9H8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Q9D9H8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Q9D9H8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Q9D9H8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Q9D9H8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Q9D9H8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Q9D9H8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Q9D9H8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Q9D9H8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Q9D9H8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Q9D9H8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Q9D9H8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Q9D9H8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Q9D9H8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Q9D9H8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Q9D9H8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Q9D9H8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Q9D9H8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Q9D9H8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Q9D9H8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Q9D9H8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Q9D9H8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Q9D9H8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Q9D9H8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Q9D9H8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Q9D9H8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Q9D9H8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Q9D9H8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Q9D9H8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Q9D9H8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Q9D9H8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Q9D9H8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Q9D9H8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Q9D9H8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Q9D9H8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Q9D9H8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Q9D9H8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Q9D9H8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Q9D9H8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Q9D9H8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Q9D9H8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Q9D9H8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Q9D9H8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Q9D9H8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Q9D9H8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Q9D9H8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Q9D9H8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Q9D9H8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Q9D9H8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Q9D9H8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Q9D9H8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Q9D9H8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms