Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D8N1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D8N1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D8N1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D8N1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D8N1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D8N1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D8N1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D8N1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D8N1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D8N1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q9D8N1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q9D8N1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D8N1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D8N1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D8N1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D8N1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D8N1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D8N1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D8N1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D8N1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D8N1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D8N1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D8N1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D8N1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D8N1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D8N1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D8N1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D8N1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D8N1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D8N1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D8N1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D8N1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q9D8N1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D8N1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D8N1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D8N1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D8N1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D8N1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D8N1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D8N1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D8N1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D8N1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D8N1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D8N1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D8N1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D8N1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D8N1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D8N1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D8N1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D8N1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D8N1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D8N1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D8N1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D8N1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D8N1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D8N1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D8N1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D8N1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D8N1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D8N1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D8N1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D8N1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D8N1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D8N1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D8N1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q9D8N1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Q9D8N1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9D8N1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q9D8N1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q9D8N1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q9D8N1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q9D8N1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Q9D8N1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D8N1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9D8N1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D8N1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms