Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan13Q9D8C2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tspan13Q9D8C2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan13Q9D8C2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan13Q9D8C2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan13Q9D8C2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan13Q9D8C2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan13Q9D8C2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan13Q9D8C2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan13Q9D8C2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan13Q9D8C2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan13Q9D8C2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan13Q9D8C2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms