Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nsmce1Q9D720 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nsmce1Q9D720 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nsmce1Q9D720 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nsmce1Q9D720 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nsmce1Q9D720 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nsmce1Q9D720 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nsmce1Q9D720 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nsmce1Q9D720 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nsmce1Q9D720 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nsmce1Q9D720 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nsmce1Q9D720 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nsmce1Q9D720 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nsmce1Q9D720 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nsmce1Q9D720 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nsmce1Q9D720 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nsmce1Q9D720 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nsmce1Q9D720 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nsmce1Q9D720 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nsmce1Q9D720 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nsmce1Q9D720 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nsmce1Q9D720 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nsmce1Q9D720 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nsmce1Q9D720 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nsmce1Q9D720 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nsmce1Q9D720 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nsmce1Q9D720 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nsmce1Q9D720 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nsmce1Q9D720 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nsmce1Q9D720 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nsmce1Q9D720 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nsmce1Q9D720 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nsmce1Q9D720 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nsmce1Q9D720 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nsmce1Q9D720 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nsmce1Q9D720 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nsmce1Q9D720 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nsmce1Q9D720 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nsmce1Q9D720 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nsmce1Q9D720 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nsmce1Q9D720 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nsmce1Q9D720 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nsmce1Q9D720 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nsmce1Q9D720 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nsmce1Q9D720 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nsmce1Q9D720 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nsmce1Q9D720 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nsmce1Q9D720 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nsmce1Q9D720 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nsmce1Q9D720 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nsmce1Q9D720 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nsmce1Q9D720 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.8 ms