Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sf3a3Q9D554 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf3a3Q9D554 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf3a3Q9D554 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sf3a3Q9D554 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3a3Q9D554 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3a3Q9D554 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3a3Q9D554 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sf3a3Q9D554 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sf3a3Q9D554 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sf3a3Q9D554 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sf3a3Q9D554 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sf3a3Q9D554 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sf3a3Q9D554 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sf3a3Q9D554 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sf3a3Q9D554 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sf3a3Q9D554 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sf3a3Q9D554 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sf3a3Q9D554 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sf3a3Q9D554 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sf3a3Q9D554 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf3a3Q9D554 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf3a3Q9D554 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf3a3Q9D554 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf3a3Q9D554 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sf3a3Q9D554 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sf3a3Q9D554 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sf3a3Q9D554 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sf3a3Q9D554 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sf3a3Q9D554 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms