Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tomm20lQ9D4V6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tomm20lQ9D4V6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tomm20lQ9D4V6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tomm20lQ9D4V6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tomm20lQ9D4V6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tomm20lQ9D4V6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tomm20lQ9D4V6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tomm20lQ9D4V6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tomm20lQ9D4V6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tomm20lQ9D4V6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tomm20lQ9D4V6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tomm20lQ9D4V6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tomm20lQ9D4V6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tomm20lQ9D4V6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tomm20lQ9D4V6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tomm20lQ9D4V6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tomm20lQ9D4V6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tomm20lQ9D4V6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tomm20lQ9D4V6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tomm20lQ9D4V6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tomm20lQ9D4V6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tomm20lQ9D4V6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tomm20lQ9D4V6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tomm20lQ9D4V6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tomm20lQ9D4V6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tomm20lQ9D4V6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tomm20lQ9D4V6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tomm20lQ9D4V6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tomm20lQ9D4V6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tomm20lQ9D4V6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tomm20lQ9D4V6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tomm20lQ9D4V6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tomm20lQ9D4V6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tomm20lQ9D4V6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tomm20lQ9D4V6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tomm20lQ9D4V6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tomm20lQ9D4V6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tomm20lQ9D4V6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tomm20lQ9D4V6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tomm20lQ9D4V6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tomm20lQ9D4V6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tomm20lQ9D4V6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tomm20lQ9D4V6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tomm20lQ9D4V6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tomm20lQ9D4V6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tomm20lQ9D4V6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tomm20lQ9D4V6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tomm20lQ9D4V6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tomm20lQ9D4V6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tomm20lQ9D4V6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tomm20lQ9D4V6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tomm20lQ9D4V6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tomm20lQ9D4V6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tomm20lQ9D4V6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tomm20lQ9D4V6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tomm20lQ9D4V6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tomm20lQ9D4V6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tomm20lQ9D4V6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tomm20lQ9D4V6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tomm20lQ9D4V6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tomm20lQ9D4V6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tomm20lQ9D4V6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tomm20lQ9D4V6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tomm20lQ9D4V6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms