Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933436I01RikQ9D3T1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933436I01RikQ9D3T1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933436I01RikQ9D3T1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933436I01RikQ9D3T1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933436I01RikQ9D3T1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933436I01RikQ9D3T1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933436I01RikQ9D3T1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933436I01RikQ9D3T1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933436I01RikQ9D3T1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
4933436I01RikQ9D3T1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933436I01RikQ9D3T1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933436I01RikQ9D3T1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933436I01RikQ9D3T1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933436I01RikQ9D3T1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933436I01RikQ9D3T1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933436I01RikQ9D3T1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933436I01RikQ9D3T1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933436I01RikQ9D3T1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933436I01RikQ9D3T1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933436I01RikQ9D3T1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933436I01RikQ9D3T1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
4933436I01RikQ9D3T1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933436I01RikQ9D3T1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933436I01RikQ9D3T1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933436I01RikQ9D3T1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933436I01RikQ9D3T1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933436I01RikQ9D3T1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933436I01RikQ9D3T1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933436I01RikQ9D3T1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933436I01RikQ9D3T1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4933436I01RikQ9D3T1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933436I01RikQ9D3T1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933436I01RikQ9D3T1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933436I01RikQ9D3T1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933436I01RikQ9D3T1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933436I01RikQ9D3T1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933436I01RikQ9D3T1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4933436I01RikQ9D3T1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933436I01RikQ9D3T1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933436I01RikQ9D3T1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933436I01RikQ9D3T1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933436I01RikQ9D3T1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933436I01RikQ9D3T1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933436I01RikQ9D3T1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933436I01RikQ9D3T1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933436I01RikQ9D3T1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
4933436I01RikQ9D3T1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933436I01RikQ9D3T1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933436I01RikQ9D3T1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933436I01RikQ9D3T1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933436I01RikQ9D3T1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933436I01RikQ9D3T1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
4933436I01RikQ9D3T1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933436I01RikQ9D3T1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933436I01RikQ9D3T1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933436I01RikQ9D3T1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933436I01RikQ9D3T1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933436I01RikQ9D3T1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933436I01RikQ9D3T1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933436I01RikQ9D3T1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933436I01RikQ9D3T1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933436I01RikQ9D3T1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933436I01RikQ9D3T1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933436I01RikQ9D3T1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933436I01RikQ9D3T1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933436I01RikQ9D3T1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933436I01RikQ9D3T1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933436I01RikQ9D3T1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933436I01RikQ9D3T1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
4933436I01RikQ9D3T1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933436I01RikQ9D3T1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933436I01RikQ9D3T1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933436I01RikQ9D3T1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933436I01RikQ9D3T1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933436I01RikQ9D3T1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms