Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms