Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

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Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf128Q9D304 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf128Q9D304 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf128Q9D304 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf128Q9D304 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf128Q9D304 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms