Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmed11Q9D2R4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmed11Q9D2R4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmed11Q9D2R4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmed11Q9D2R4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmed11Q9D2R4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed11Q9D2R4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed11Q9D2R4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed11Q9D2R4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed11Q9D2R4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed11Q9D2R4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed11Q9D2R4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed11Q9D2R4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed11Q9D2R4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed11Q9D2R4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed11Q9D2R4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed11Q9D2R4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed11Q9D2R4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed11Q9D2R4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed11Q9D2R4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed11Q9D2R4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed11Q9D2R4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed11Q9D2R4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed11Q9D2R4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed11Q9D2R4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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