Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9D1F3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9D1F3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9D1F3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9D1F3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9D1F3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9D1F3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9D1F3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9D1F3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9D1F3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9D1F3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9D1F3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9D1F3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q9D1F3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Q9D1F3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Q9D1F3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q9D1F3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9D1F3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9D1F3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9D1F3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9D1F3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Q9D1F3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9D1F3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D1F3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D1F3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9D1F3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9D1F3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9D1F3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9D1F3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9D1F3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9D1F3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9D1F3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9D1F3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9D1F3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9D1F3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9D1F3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9D1F3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q9D1F3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Q9D1F3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q9D1F3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q9D1F3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q9D1F3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q9D1F3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q9D1F3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q9D1F3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q9D1F3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9D1F3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9D1F3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9D1F3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q9D1F3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q9D1F3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q9D1F3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q9D1F3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Q9D1F3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Q9D1F3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9D1F3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9D1F3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9D1F3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9D1F3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9D1F3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9D1F3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9D1F3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9D1F3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9D1F3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9D1F3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9D1F3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9D1F3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9D1F3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9D1F3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D1F3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D1F3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D1F3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D1F3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D1F3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D1F3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9D1F3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9D1F3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9D1F3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9D1F3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9D1F3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9D1F3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9D1F3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9D1F3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9D1F3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D1F3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D1F3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9D1F3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9D1F3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9D1F3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9D1F3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9D1F3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9D1F3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9D1F3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9D1F3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9D1F3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9D1F3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9D1F3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9D1F3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9D1F3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9D1F3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms