Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ss18l2Q9D174 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ss18l2Q9D174 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ss18l2Q9D174 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ss18l2Q9D174 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ss18l2Q9D174 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ss18l2Q9D174 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ss18l2Q9D174 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ss18l2Q9D174 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ss18l2Q9D174 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ss18l2Q9D174 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ss18l2Q9D174 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ss18l2Q9D174 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ss18l2Q9D174 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ss18l2Q9D174 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ss18l2Q9D174 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ss18l2Q9D174 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ss18l2Q9D174 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ss18l2Q9D174 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ss18l2Q9D174 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms