Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZY3

Ube2v1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2v1Q9CZY3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2v1Q9CZY3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2v1Q9CZY3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2v1Q9CZY3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2v1Q9CZY3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ube2v1Q9CZY3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms