Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Utp11Q9CZJ1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Utp11Q9CZJ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Utp11Q9CZJ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Utp11Q9CZJ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Utp11Q9CZJ1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Utp11Q9CZJ1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Utp11Q9CZJ1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp11Q9CZJ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp11Q9CZJ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp11Q9CZJ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp11Q9CZJ1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Utp11Q9CZJ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Utp11Q9CZJ1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Utp11Q9CZJ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Utp11Q9CZJ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Utp11Q9CZJ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Utp11Q9CZJ1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Utp11Q9CZJ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Utp11Q9CZJ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Utp11Q9CZJ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Utp11Q9CZJ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Utp11Q9CZJ1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Utp11Q9CZJ1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Utp11Q9CZJ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Utp11Q9CZJ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Utp11Q9CZJ1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Utp11Q9CZJ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Utp11Q9CZJ1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Utp11Q9CZJ1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Utp11Q9CZJ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Utp11Q9CZJ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Utp11Q9CZJ1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Utp11Q9CZJ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Utp11Q9CZJ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Utp11Q9CZJ1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Utp11Q9CZJ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Utp11Q9CZJ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Utp11Q9CZJ1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Utp11Q9CZJ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Utp11Q9CZJ1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Utp11Q9CZJ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Utp11Q9CZJ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Utp11Q9CZJ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Utp11Q9CZJ1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Utp11Q9CZJ1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Utp11Q9CZJ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Utp11Q9CZJ1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Utp11Q9CZJ1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Utp11Q9CZJ1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Utp11Q9CZJ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Utp11Q9CZJ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Utp11Q9CZJ1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Utp11Q9CZJ1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Utp11Q9CZJ1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Utp11Q9CZJ1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Utp11Q9CZJ1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Utp11Q9CZJ1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utp11Q9CZJ1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utp11Q9CZJ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utp11Q9CZJ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Utp11Q9CZJ1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Utp11Q9CZJ1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Utp11Q9CZJ1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Utp11Q9CZJ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Utp11Q9CZJ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Utp11Q9CZJ1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Utp11Q9CZJ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Utp11Q9CZJ1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp11Q9CZJ1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp11Q9CZJ1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp11Q9CZJ1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp11Q9CZJ1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp11Q9CZJ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp11Q9CZJ1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Utp11Q9CZJ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Utp11Q9CZJ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Utp11Q9CZJ1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms