Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nde1Q9CZA6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nde1Q9CZA6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nde1Q9CZA6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nde1Q9CZA6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nde1Q9CZA6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nde1Q9CZA6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nde1Q9CZA6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nde1Q9CZA6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nde1Q9CZA6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nde1Q9CZA6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nde1Q9CZA6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nde1Q9CZA6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nde1Q9CZA6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nde1Q9CZA6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nde1Q9CZA6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nde1Q9CZA6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nde1Q9CZA6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nde1Q9CZA6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nde1Q9CZA6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nde1Q9CZA6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nde1Q9CZA6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nde1Q9CZA6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nde1Q9CZA6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nde1Q9CZA6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nde1Q9CZA6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nde1Q9CZA6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nde1Q9CZA6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nde1Q9CZA6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nde1Q9CZA6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nde1Q9CZA6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nde1Q9CZA6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nde1Q9CZA6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nde1Q9CZA6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nde1Q9CZA6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nde1Q9CZA6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nde1Q9CZA6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nde1Q9CZA6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nde1Q9CZA6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nde1Q9CZA6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nde1Q9CZA6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nde1Q9CZA6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nde1Q9CZA6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nde1Q9CZA6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nde1Q9CZA6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nde1Q9CZA6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nde1Q9CZA6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nde1Q9CZA6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nde1Q9CZA6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nde1Q9CZA6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nde1Q9CZA6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nde1Q9CZA6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nde1Q9CZA6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nde1Q9CZA6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nde1Q9CZA6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nde1Q9CZA6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nde1Q9CZA6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms