Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem50aQ9CXL1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem50aQ9CXL1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem50aQ9CXL1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem50aQ9CXL1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem50aQ9CXL1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem50aQ9CXL1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem50aQ9CXL1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmem50aQ9CXL1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem50aQ9CXL1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem50aQ9CXL1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem50aQ9CXL1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem50aQ9CXL1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem50aQ9CXL1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem50aQ9CXL1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem50aQ9CXL1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem50aQ9CXL1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem50aQ9CXL1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem50aQ9CXL1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem50aQ9CXL1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem50aQ9CXL1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem50aQ9CXL1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem50aQ9CXL1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem50aQ9CXL1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem50aQ9CXL1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem50aQ9CXL1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem50aQ9CXL1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem50aQ9CXL1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem50aQ9CXL1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem50aQ9CXL1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmem50aQ9CXL1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms