Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnot11Q9CWN7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot11Q9CWN7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot11Q9CWN7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot11Q9CWN7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot11Q9CWN7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot11Q9CWN7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot11Q9CWN7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot11Q9CWN7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot11Q9CWN7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot11Q9CWN7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot11Q9CWN7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot11Q9CWN7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnot11Q9CWN7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot11Q9CWN7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot11Q9CWN7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot11Q9CWN7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot11Q9CWN7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot11Q9CWN7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot11Q9CWN7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot11Q9CWN7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot11Q9CWN7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot11Q9CWN7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot11Q9CWN7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot11Q9CWN7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot11Q9CWN7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot11Q9CWN7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot11Q9CWN7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot11Q9CWN7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot11Q9CWN7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot11Q9CWN7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnot11Q9CWN7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot11Q9CWN7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot11Q9CWN7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot11Q9CWN7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot11Q9CWN7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot11Q9CWN7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot11Q9CWN7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot11Q9CWN7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot11Q9CWN7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot11Q9CWN7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot11Q9CWN7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot11Q9CWN7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot11Q9CWN7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot11Q9CWN7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot11Q9CWN7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnot11Q9CWN7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnot11Q9CWN7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot11Q9CWN7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot11Q9CWN7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot11Q9CWN7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot11Q9CWN7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot11Q9CWN7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot11Q9CWN7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnot11Q9CWN7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnot11Q9CWN7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot11Q9CWN7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot11Q9CWN7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot11Q9CWN7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot11Q9CWN7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot11Q9CWN7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot11Q9CWN7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot11Q9CWN7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot11Q9CWN7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot11Q9CWN7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot11Q9CWN7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot11Q9CWN7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot11Q9CWN7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot11Q9CWN7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot11Q9CWN7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot11Q9CWN7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot11Q9CWN7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot11Q9CWN7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot11Q9CWN7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot11Q9CWN7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot11Q9CWN7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot11Q9CWN7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot11Q9CWN7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot11Q9CWN7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot11Q9CWN7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot11Q9CWN7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot11Q9CWN7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot11Q9CWN7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot11Q9CWN7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot11Q9CWN7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot11Q9CWN7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot11Q9CWN7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot11Q9CWN7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cnot11Q9CWN7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cnot11Q9CWN7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cnot11Q9CWN7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnot11Q9CWN7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnot11Q9CWN7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnot11Q9CWN7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnot11Q9CWN7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnot11Q9CWN7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnot11Q9CWN7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnot11Q9CWN7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot11Q9CWN7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot11Q9CWN7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms