Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smurf1Q9CUN6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smurf1Q9CUN6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smurf1Q9CUN6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smurf1Q9CUN6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smurf1Q9CUN6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smurf1Q9CUN6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smurf1Q9CUN6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smurf1Q9CUN6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smurf1Q9CUN6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smurf1Q9CUN6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smurf1Q9CUN6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smurf1Q9CUN6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smurf1Q9CUN6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smurf1Q9CUN6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smurf1Q9CUN6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smurf1Q9CUN6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Smurf1Q9CUN6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smurf1Q9CUN6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smurf1Q9CUN6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smurf1Q9CUN6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smurf1Q9CUN6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smurf1Q9CUN6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smurf1Q9CUN6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smurf1Q9CUN6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Smurf1Q9CUN6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smurf1Q9CUN6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smurf1Q9CUN6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smurf1Q9CUN6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smurf1Q9CUN6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smurf1Q9CUN6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smurf1Q9CUN6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smurf1Q9CUN6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smurf1Q9CUN6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smurf1Q9CUN6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smurf1Q9CUN6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smurf1Q9CUN6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smurf1Q9CUN6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Smurf1Q9CUN6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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