Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRZ8

Tspo2, Translocator protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspo2Q9CRZ8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspo2Q9CRZ8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tspo2Q9CRZ8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tspo2Q9CRZ8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspo2Q9CRZ8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspo2Q9CRZ8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms