Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931417E11RikQ9CR05 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4931417E11RikQ9CR05 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4931417E11RikQ9CR05 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931417E11RikQ9CR05 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931417E11RikQ9CR05 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931417E11RikQ9CR05 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931417E11RikQ9CR05 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931417E11RikQ9CR05 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4931417E11RikQ9CR05 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4931417E11RikQ9CR05 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4931417E11RikQ9CR05 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4931417E11RikQ9CR05 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4931417E11RikQ9CR05 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4931417E11RikQ9CR05 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931417E11RikQ9CR05 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931417E11RikQ9CR05 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931417E11RikQ9CR05 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931417E11RikQ9CR05 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
4931417E11RikQ9CR05 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931417E11RikQ9CR05 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931417E11RikQ9CR05 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931417E11RikQ9CR05 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931417E11RikQ9CR05 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4931417E11RikQ9CR05 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4931417E11RikQ9CR05 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4931417E11RikQ9CR05 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
4931417E11RikQ9CR05 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
4931417E11RikQ9CR05 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4931417E11RikQ9CR05 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4931417E11RikQ9CR05 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931417E11RikQ9CR05 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931417E11RikQ9CR05 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931417E11RikQ9CR05 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931417E11RikQ9CR05 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4931417E11RikQ9CR05 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4931417E11RikQ9CR05 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4931417E11RikQ9CR05 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931417E11RikQ9CR05 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931417E11RikQ9CR05 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931417E11RikQ9CR05 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4931417E11RikQ9CR05 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4931417E11RikQ9CR05 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4931417E11RikQ9CR05 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4931417E11RikQ9CR05 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4931417E11RikQ9CR05 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4931417E11RikQ9CR05 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
4931417E11RikQ9CR05 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
4931417E11RikQ9CR05 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4931417E11RikQ9CR05 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4931417E11RikQ9CR05 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
4931417E11RikQ9CR05 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4931417E11RikQ9CR05 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4931417E11RikQ9CR05 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4931417E11RikQ9CR05 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4931417E11RikQ9CR05 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4931417E11RikQ9CR05 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4931417E11RikQ9CR05 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4931417E11RikQ9CR05 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4931417E11RikQ9CR05 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4931417E11RikQ9CR05 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4931417E11RikQ9CR05 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4931417E11RikQ9CR05 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4931417E11RikQ9CR05 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4931417E11RikQ9CR05 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4931417E11RikQ9CR05 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931417E11RikQ9CR05 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4931417E11RikQ9CR05 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931417E11RikQ9CR05 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4931417E11RikQ9CR05 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931417E11RikQ9CR05 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4931417E11RikQ9CR05 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931417E11RikQ9CR05 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4931417E11RikQ9CR05 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms