Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ergic3Q9CQE7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ergic3Q9CQE7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ergic3Q9CQE7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ergic3Q9CQE7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ergic3Q9CQE7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ergic3Q9CQE7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ergic3Q9CQE7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ergic3Q9CQE7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ergic3Q9CQE7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ergic3Q9CQE7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ergic3Q9CQE7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ergic3Q9CQE7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ergic3Q9CQE7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ergic3Q9CQE7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ergic3Q9CQE7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ergic3Q9CQE7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ergic3Q9CQE7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ergic3Q9CQE7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ergic3Q9CQE7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ergic3Q9CQE7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ergic3Q9CQE7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ergic3Q9CQE7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ergic3Q9CQE7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ergic3Q9CQE7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ergic3Q9CQE7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ergic3Q9CQE7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ergic3Q9CQE7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ergic3Q9CQE7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ergic3Q9CQE7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ergic3Q9CQE7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ergic3Q9CQE7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ergic3Q9CQE7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ergic3Q9CQE7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ergic3Q9CQE7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ergic3Q9CQE7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ergic3Q9CQE7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ergic3Q9CQE7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ergic3Q9CQE7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ergic3Q9CQE7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ergic3Q9CQE7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ergic3Q9CQE7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ergic3Q9CQE7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ergic3Q9CQE7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ergic3Q9CQE7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ergic3Q9CQE7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ergic3Q9CQE7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ergic3Q9CQE7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ergic3Q9CQE7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ergic3Q9CQE7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ergic3Q9CQE7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ergic3Q9CQE7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ergic3Q9CQE7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Ergic3Q9CQE7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ergic3Q9CQE7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ergic3Q9CQE7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ergic3Q9CQE7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ergic3Q9CQE7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ergic3Q9CQE7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ergic3Q9CQE7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ergic3Q9CQE7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ergic3Q9CQE7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ergic3Q9CQE7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ergic3Q9CQE7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ergic3Q9CQE7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ergic3Q9CQE7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ergic3Q9CQE7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ergic3Q9CQE7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ergic3Q9CQE7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ergic3Q9CQE7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ergic3Q9CQE7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ergic3Q9CQE7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ergic3Q9CQE7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ergic3Q9CQE7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ergic3Q9CQE7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms