Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ11

2010109I03Rik, RIKEN cDNA 2010109I03, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010109I03RikQ9CQ11 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
2010109I03RikQ9CQ11 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2010109I03RikQ9CQ11 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
2010109I03RikQ9CQ11 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
2010109I03RikQ9CQ11 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
2010109I03RikQ9CQ11 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
2010109I03RikQ9CQ11 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms