Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ino80bQ99PT3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ino80bQ99PT3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ino80bQ99PT3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ino80bQ99PT3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ino80bQ99PT3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ino80bQ99PT3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ino80bQ99PT3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ino80bQ99PT3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ino80bQ99PT3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ino80bQ99PT3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ino80bQ99PT3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ino80bQ99PT3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ino80bQ99PT3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ino80bQ99PT3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ino80bQ99PT3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ino80bQ99PT3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ino80bQ99PT3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ino80bQ99PT3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ino80bQ99PT3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ino80bQ99PT3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ino80bQ99PT3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ino80bQ99PT3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ino80bQ99PT3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ino80bQ99PT3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ino80bQ99PT3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ino80bQ99PT3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ino80bQ99PT3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ino80bQ99PT3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ino80bQ99PT3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ino80bQ99PT3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ino80bQ99PT3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ino80bQ99PT3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ino80bQ99PT3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ino80bQ99PT3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ino80bQ99PT3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ino80bQ99PT3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ino80bQ99PT3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ino80bQ99PT3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ino80bQ99PT3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ino80bQ99PT3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ino80bQ99PT3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ino80bQ99PT3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ino80bQ99PT3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ino80bQ99PT3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ino80bQ99PT3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ino80bQ99PT3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ino80bQ99PT3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ino80bQ99PT3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ino80bQ99PT3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ino80bQ99PT3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ino80bQ99PT3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ino80bQ99PT3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ino80bQ99PT3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ino80bQ99PT3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ino80bQ99PT3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ino80bQ99PT3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ino80bQ99PT3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ino80bQ99PT3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ino80bQ99PT3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ino80bQ99PT3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ino80bQ99PT3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ino80bQ99PT3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ino80bQ99PT3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ino80bQ99PT3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ino80bQ99PT3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ino80bQ99PT3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ino80bQ99PT3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ino80bQ99PT3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ino80bQ99PT3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ino80bQ99PT3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ino80bQ99PT3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ino80bQ99PT3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ino80bQ99PT3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ino80bQ99PT3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ino80bQ99PT3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ino80bQ99PT3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms