Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pramel1Q99MW3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pramel1Q99MW3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pramel1Q99MW3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pramel1Q99MW3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pramel1Q99MW3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pramel1Q99MW3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pramel1Q99MW3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pramel1Q99MW3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Pramel1Q99MW3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pramel1Q99MW3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pramel1Q99MW3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Pramel1Q99MW3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pramel1Q99MW3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pramel1Q99MW3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pramel1Q99MW3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pramel1Q99MW3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pramel1Q99MW3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pramel1Q99MW3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pramel1Q99MW3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pramel1Q99MW3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pramel1Q99MW3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pramel1Q99MW3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pramel1Q99MW3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pramel1Q99MW3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pramel1Q99MW3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pramel1Q99MW3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pramel1Q99MW3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pramel1Q99MW3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pramel1Q99MW3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pramel1Q99MW3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pramel1Q99MW3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pramel1Q99MW3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pramel1Q99MW3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pramel1Q99MW3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pramel1Q99MW3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pramel1Q99MW3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pramel1Q99MW3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pramel1Q99MW3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pramel1Q99MW3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pramel1Q99MW3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pramel1Q99MW3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pramel1Q99MW3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pramel1Q99MW3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pramel1Q99MW3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramel1Q99MW3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramel1Q99MW3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramel1Q99MW3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramel1Q99MW3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramel1Q99MW3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pramel1Q99MW3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramel1Q99MW3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pramel1Q99MW3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramel1Q99MW3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramel1Q99MW3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pramel1Q99MW3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pramel1Q99MW3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pramel1Q99MW3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramel1Q99MW3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pramel1Q99MW3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramel1Q99MW3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramel1Q99MW3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramel1Q99MW3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramel1Q99MW3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramel1Q99MW3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pramel1Q99MW3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel1Q99MW3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel1Q99MW3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel1Q99MW3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pramel1Q99MW3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel1Q99MW3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pramel1Q99MW3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pramel1Q99MW3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pramel1Q99MW3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pramel1Q99MW3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pramel1Q99MW3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramel1Q99MW3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pramel1Q99MW3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel1Q99MW3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel1Q99MW3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel1Q99MW3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pramel1Q99MW3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel1Q99MW3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel1Q99MW3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pramel1Q99MW3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel1Q99MW3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel1Q99MW3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pramel1Q99MW3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pramel1Q99MW3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pramel1Q99MW3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pramel1Q99MW3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pramel1Q99MW3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pramel1Q99MW3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pramel1Q99MW3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pramel1Q99MW3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pramel1Q99MW3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pramel1Q99MW3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pramel1Q99MW3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pramel1Q99MW3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pramel1Q99MW3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms