Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SrrtQ99MR6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SrrtQ99MR6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SrrtQ99MR6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SrrtQ99MR6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SrrtQ99MR6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SrrtQ99MR6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SrrtQ99MR6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SrrtQ99MR6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SrrtQ99MR6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SrrtQ99MR6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SrrtQ99MR6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SrrtQ99MR6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SrrtQ99MR6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SrrtQ99MR6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SrrtQ99MR6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SrrtQ99MR6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SrrtQ99MR6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SrrtQ99MR6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SrrtQ99MR6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SrrtQ99MR6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SrrtQ99MR6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SrrtQ99MR6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SrrtQ99MR6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SrrtQ99MR6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SrrtQ99MR6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SrrtQ99MR6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SrrtQ99MR6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SrrtQ99MR6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SrrtQ99MR6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SrrtQ99MR6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SrrtQ99MR6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SrrtQ99MR6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SrrtQ99MR6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SrrtQ99MR6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SrrtQ99MR6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SrrtQ99MR6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SrrtQ99MR6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SrrtQ99MR6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SrrtQ99MR6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SrrtQ99MR6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SrrtQ99MR6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SrrtQ99MR6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SrrtQ99MR6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SrrtQ99MR6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SrrtQ99MR6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SrrtQ99MR6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SrrtQ99MR6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SrrtQ99MR6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SrrtQ99MR6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SrrtQ99MR6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SrrtQ99MR6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SrrtQ99MR6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SrrtQ99MR6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SrrtQ99MR6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SrrtQ99MR6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SrrtQ99MR6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SrrtQ99MR6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SrrtQ99MR6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SrrtQ99MR6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SrrtQ99MR6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SrrtQ99MR6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SrrtQ99MR6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SrrtQ99MR6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SrrtQ99MR6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SrrtQ99MR6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SrrtQ99MR6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SrrtQ99MR6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SrrtQ99MR6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SrrtQ99MR6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SrrtQ99MR6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SrrtQ99MR6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SrrtQ99MR6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SrrtQ99MR6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SrrtQ99MR6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SrrtQ99MR6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SrrtQ99MR6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SrrtQ99MR6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SrrtQ99MR6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SrrtQ99MR6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SrrtQ99MR6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SrrtQ99MR6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SrrtQ99MR6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SrrtQ99MR6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SrrtQ99MR6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SrrtQ99MR6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SrrtQ99MR6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SrrtQ99MR6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SrrtQ99MR6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SrrtQ99MR6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SrrtQ99MR6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SrrtQ99MR6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SrrtQ99MR6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SrrtQ99MR6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SrrtQ99MR6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SrrtQ99MR6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SrrtQ99MR6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SrrtQ99MR6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SrrtQ99MR6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SrrtQ99MR6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms