Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk5rap3Q99LM2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk5rap3Q99LM2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk5rap3Q99LM2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk5rap3Q99LM2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk5rap3Q99LM2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk5rap3Q99LM2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdk5rap3Q99LM2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdk5rap3Q99LM2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk5rap3Q99LM2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk5rap3Q99LM2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk5rap3Q99LM2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk5rap3Q99LM2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk5rap3Q99LM2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk5rap3Q99LM2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk5rap3Q99LM2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk5rap3Q99LM2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk5rap3Q99LM2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk5rap3Q99LM2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk5rap3Q99LM2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk5rap3Q99LM2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk5rap3Q99LM2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk5rap3Q99LM2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk5rap3Q99LM2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk5rap3Q99LM2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk5rap3Q99LM2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk5rap3Q99LM2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk5rap3Q99LM2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk5rap3Q99LM2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk5rap3Q99LM2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk5rap3Q99LM2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk5rap3Q99LM2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk5rap3Q99LM2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk5rap3Q99LM2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk5rap3Q99LM2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk5rap3Q99LM2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk5rap3Q99LM2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk5rap3Q99LM2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk5rap3Q99LM2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk5rap3Q99LM2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk5rap3Q99LM2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk5rap3Q99LM2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk5rap3Q99LM2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk5rap3Q99LM2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk5rap3Q99LM2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap3Q99LM2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap3Q99LM2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap3Q99LM2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap3Q99LM2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk5rap3Q99LM2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk5rap3Q99LM2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk5rap3Q99LM2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk5rap3Q99LM2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk5rap3Q99LM2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk5rap3Q99LM2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk5rap3Q99LM2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk5rap3Q99LM2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk5rap3Q99LM2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk5rap3Q99LM2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk5rap3Q99LM2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk5rap3Q99LM2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk5rap3Q99LM2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk5rap3Q99LM2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk5rap3Q99LM2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk5rap3Q99LM2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk5rap3Q99LM2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk5rap3Q99LM2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdk5rap3Q99LM2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk5rap3Q99LM2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk5rap3Q99LM2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk5rap3Q99LM2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk5rap3Q99LM2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk5rap3Q99LM2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk5rap3Q99LM2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk5rap3Q99LM2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk5rap3Q99LM2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk5rap3Q99LM2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk5rap3Q99LM2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdk5rap3Q99LM2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk5rap3Q99LM2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk5rap3Q99LM2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk5rap3Q99LM2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk5rap3Q99LM2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk5rap3Q99LM2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk5rap3Q99LM2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk5rap3Q99LM2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk5rap3Q99LM2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk5rap3Q99LM2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk5rap3Q99LM2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk5rap3Q99LM2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk5rap3Q99LM2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk5rap3Q99LM2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cdk5rap3Q99LM2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms