Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Emc3Q99KI3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Emc3Q99KI3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Emc3Q99KI3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Emc3Q99KI3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Emc3Q99KI3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Emc3Q99KI3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Emc3Q99KI3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Emc3Q99KI3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Emc3Q99KI3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Emc3Q99KI3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Emc3Q99KI3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Emc3Q99KI3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Emc3Q99KI3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Emc3Q99KI3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Emc3Q99KI3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Emc3Q99KI3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Emc3Q99KI3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Emc3Q99KI3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Emc3Q99KI3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Emc3Q99KI3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Emc3Q99KI3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Emc3Q99KI3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Emc3Q99KI3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Emc3Q99KI3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Emc3Q99KI3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Emc3Q99KI3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Emc3Q99KI3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Emc3Q99KI3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Emc3Q99KI3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Emc3Q99KI3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Emc3Q99KI3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Emc3Q99KI3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Emc3Q99KI3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Emc3Q99KI3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Emc3Q99KI3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Emc3Q99KI3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Emc3Q99KI3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Emc3Q99KI3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Emc3Q99KI3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Emc3Q99KI3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Emc3Q99KI3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Emc3Q99KI3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Emc3Q99KI3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Emc3Q99KI3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Emc3Q99KI3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Emc3Q99KI3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Emc3Q99KI3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emc3Q99KI3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Emc3Q99KI3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Emc3Q99KI3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Emc3Q99KI3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Emc3Q99KI3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Emc3Q99KI3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Emc3Q99KI3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms