Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SmagpQ99KC7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SmagpQ99KC7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SmagpQ99KC7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SmagpQ99KC7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SmagpQ99KC7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SmagpQ99KC7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmagpQ99KC7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SmagpQ99KC7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SmagpQ99KC7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SmagpQ99KC7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SmagpQ99KC7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SmagpQ99KC7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SmagpQ99KC7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SmagpQ99KC7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SmagpQ99KC7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SmagpQ99KC7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SmagpQ99KC7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SmagpQ99KC7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SmagpQ99KC7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SmagpQ99KC7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SmagpQ99KC7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SmagpQ99KC7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SmagpQ99KC7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SmagpQ99KC7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SmagpQ99KC7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SmagpQ99KC7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmagpQ99KC7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmagpQ99KC7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmagpQ99KC7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmagpQ99KC7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmagpQ99KC7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SmagpQ99KC7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmagpQ99KC7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmagpQ99KC7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmagpQ99KC7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SmagpQ99KC7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SmagpQ99KC7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SmagpQ99KC7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SmagpQ99KC7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SmagpQ99KC7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SmagpQ99KC7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SmagpQ99KC7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SmagpQ99KC7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SmagpQ99KC7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SmagpQ99KC7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SmagpQ99KC7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SmagpQ99KC7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SmagpQ99KC7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SmagpQ99KC7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SmagpQ99KC7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SmagpQ99KC7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SmagpQ99KC7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SmagpQ99KC7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SmagpQ99KC7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SmagpQ99KC7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SmagpQ99KC7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SmagpQ99KC7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SmagpQ99KC7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SmagpQ99KC7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SmagpQ99KC7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SmagpQ99KC7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SmagpQ99KC7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SmagpQ99KC7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SmagpQ99KC7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SmagpQ99KC7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms