Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdxdc1Q99K01 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdxdc1Q99K01 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdxdc1Q99K01 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pdxdc1Q99K01 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pdxdc1Q99K01 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pdxdc1Q99K01 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdxdc1Q99K01 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdxdc1Q99K01 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdxdc1Q99K01 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdxdc1Q99K01 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pdxdc1Q99K01 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdxdc1Q99K01 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdxdc1Q99K01 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdxdc1Q99K01 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pdxdc1Q99K01 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdxdc1Q99K01 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pdxdc1Q99K01 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pdxdc1Q99K01 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pdxdc1Q99K01 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pdxdc1Q99K01 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pdxdc1Q99K01 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pdxdc1Q99K01 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdxdc1Q99K01 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pdxdc1Q99K01 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdxdc1Q99K01 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdxdc1Q99K01 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pdxdc1Q99K01 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdxdc1Q99K01 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pdxdc1Q99K01 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdxdc1Q99K01 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdxdc1Q99K01 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdxdc1Q99K01 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdxdc1Q99K01 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pdxdc1Q99K01 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdxdc1Q99K01 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdxdc1Q99K01 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pdxdc1Q99K01 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdxdc1Q99K01 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdxdc1Q99K01 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pdxdc1Q99K01 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pdxdc1Q99K01 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pdxdc1Q99K01 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pdxdc1Q99K01 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdxdc1Q99K01 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdxdc1Q99K01 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pdxdc1Q99K01 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdxdc1Q99K01 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdxdc1Q99K01 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdxdc1Q99K01 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdxdc1Q99K01 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pdxdc1Q99K01 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pdxdc1Q99K01 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdxdc1Q99K01 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdxdc1Q99K01 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdxdc1Q99K01 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdxdc1Q99K01 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdxdc1Q99K01 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdxdc1Q99K01 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdxdc1Q99K01 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdxdc1Q99K01 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdxdc1Q99K01 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdxdc1Q99K01 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdxdc1Q99K01 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdxdc1Q99K01 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdxdc1Q99K01 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdxdc1Q99K01 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdxdc1Q99K01 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdxdc1Q99K01 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdxdc1Q99K01 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdxdc1Q99K01 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdxdc1Q99K01 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdxdc1Q99K01 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdxdc1Q99K01 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdxdc1Q99K01 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdxdc1Q99K01 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdxdc1Q99K01 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pdxdc1Q99K01 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdxdc1Q99K01 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdxdc1Q99K01 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdxdc1Q99K01 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdxdc1Q99K01 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdxdc1Q99K01 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdxdc1Q99K01 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdxdc1Q99K01 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdxdc1Q99K01 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdxdc1Q99K01 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdxdc1Q99K01 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdxdc1Q99K01 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdxdc1Q99K01 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdxdc1Q99K01 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdxdc1Q99K01 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdxdc1Q99K01 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdxdc1Q99K01 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdxdc1Q99K01 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdxdc1Q99K01 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdxdc1Q99K01 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdxdc1Q99K01 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdxdc1Q99K01 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdxdc1Q99K01 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms