Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Higd1bQ99JY6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Higd1bQ99JY6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Higd1bQ99JY6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Higd1bQ99JY6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Higd1bQ99JY6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms