Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spef1Q99JL1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spef1Q99JL1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spef1Q99JL1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spef1Q99JL1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spef1Q99JL1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spef1Q99JL1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spef1Q99JL1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spef1Q99JL1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spef1Q99JL1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spef1Q99JL1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spef1Q99JL1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spef1Q99JL1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spef1Q99JL1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spef1Q99JL1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spef1Q99JL1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spef1Q99JL1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spef1Q99JL1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spef1Q99JL1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spef1Q99JL1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spef1Q99JL1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spef1Q99JL1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Spef1Q99JL1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spef1Q99JL1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spef1Q99JL1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spef1Q99JL1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spef1Q99JL1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spef1Q99JL1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spef1Q99JL1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spef1Q99JL1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spef1Q99JL1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spef1Q99JL1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spef1Q99JL1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Spef1Q99JL1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spef1Q99JL1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spef1Q99JL1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spef1Q99JL1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spef1Q99JL1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spef1Q99JL1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spef1Q99JL1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spef1Q99JL1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spef1Q99JL1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spef1Q99JL1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spef1Q99JL1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spef1Q99JL1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spef1Q99JL1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spef1Q99JL1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spef1Q99JL1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spef1Q99JL1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Spef1Q99JL1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spef1Q99JL1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spef1Q99JL1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spef1Q99JL1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef1Q99JL1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef1Q99JL1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef1Q99JL1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef1Q99JL1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef1Q99JL1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spef1Q99JL1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spef1Q99JL1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spef1Q99JL1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Spef1Q99JL1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spef1Q99JL1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spef1Q99JL1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spef1Q99JL1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spef1Q99JL1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spef1Q99JL1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spef1Q99JL1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Spef1Q99JL1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms