Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Apobec3Q99J72 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Apobec3Q99J72 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apobec3Q99J72 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apobec3Q99J72 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Apobec3Q99J72 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Apobec3Q99J72 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apobec3Q99J72 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apobec3Q99J72 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Apobec3Q99J72 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Apobec3Q99J72 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Apobec3Q99J72 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Apobec3Q99J72 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Apobec3Q99J72 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Apobec3Q99J72 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apobec3Q99J72 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Apobec3Q99J72 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Apobec3Q99J72 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apobec3Q99J72 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apobec3Q99J72 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apobec3Q99J72 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Apobec3Q99J72 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apobec3Q99J72 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Apobec3Q99J72 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apobec3Q99J72 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Apobec3Q99J72 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Apobec3Q99J72 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apobec3Q99J72 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apobec3Q99J72 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apobec3Q99J72 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Apobec3Q99J72 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Apobec3Q99J72 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Apobec3Q99J72 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apobec3Q99J72 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apobec3Q99J72 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apobec3Q99J72 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apobec3Q99J72 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Apobec3Q99J72 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apobec3Q99J72 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apobec3Q99J72 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Apobec3Q99J72 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apobec3Q99J72 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apobec3Q99J72 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Apobec3Q99J72 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Apobec3Q99J72 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Apobec3Q99J72 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Apobec3Q99J72 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Apobec3Q99J72 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apobec3Q99J72 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Apobec3Q99J72 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Apobec3Q99J72 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Apobec3Q99J72 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Apobec3Q99J72 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Apobec3Q99J72 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apobec3Q99J72 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apobec3Q99J72 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apobec3Q99J72 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apobec3Q99J72 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apobec3Q99J72 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Apobec3Q99J72 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Apobec3Q99J72 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Apobec3Q99J72 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Apobec3Q99J72 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Apobec3Q99J72 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Apobec3Q99J72 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Apobec3Q99J72 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Apobec3Q99J72 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Apobec3Q99J72 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Apobec3Q99J72 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Apobec3Q99J72 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apobec3Q99J72 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apobec3Q99J72 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apobec3Q99J72 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apobec3Q99J72 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Apobec3Q99J72 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apobec3Q99J72 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Apobec3Q99J72 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Apobec3Q99J72 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Apobec3Q99J72 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apobec3Q99J72 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apobec3Q99J72 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Apobec3Q99J72 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apobec3Q99J72 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apobec3Q99J72 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Apobec3Q99J72 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Apobec3Q99J72 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Apobec3Q99J72 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Apobec3Q99J72 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Apobec3Q99J72 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Apobec3Q99J72 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Apobec3Q99J72 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apobec3Q99J72 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Apobec3Q99J72 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Apobec3Q99J72 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Apobec3Q99J72 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apobec3Q99J72 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Apobec3Q99J72 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apobec3Q99J72 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Apobec3Q99J72 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Apobec3Q99J72 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms