Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Alpk3Q924C5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Alpk3Q924C5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Alpk3Q924C5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Alpk3Q924C5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Alpk3Q924C5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Alpk3Q924C5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Alpk3Q924C5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Alpk3Q924C5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Alpk3Q924C5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Alpk3Q924C5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Alpk3Q924C5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Alpk3Q924C5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Alpk3Q924C5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Alpk3Q924C5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Alpk3Q924C5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Alpk3Q924C5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Alpk3Q924C5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Alpk3Q924C5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Alpk3Q924C5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Alpk3Q924C5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Alpk3Q924C5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Alpk3Q924C5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Alpk3Q924C5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Alpk3Q924C5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Alpk3Q924C5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Alpk3Q924C5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Alpk3Q924C5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Alpk3Q924C5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Alpk3Q924C5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Alpk3Q924C5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Alpk3Q924C5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Alpk3Q924C5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Alpk3Q924C5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Alpk3Q924C5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Alpk3Q924C5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Alpk3Q924C5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Alpk3Q924C5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Alpk3Q924C5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Alpk3Q924C5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Alpk3Q924C5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Alpk3Q924C5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Alpk3Q924C5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Alpk3Q924C5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Alpk3Q924C5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Alpk3Q924C5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Alpk3Q924C5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Alpk3Q924C5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Alpk3Q924C5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Alpk3Q924C5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Alpk3Q924C5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Alpk3Q924C5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Alpk3Q924C5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Alpk3Q924C5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Alpk3Q924C5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Alpk3Q924C5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Alpk3Q924C5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Alpk3Q924C5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Alpk3Q924C5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Alpk3Q924C5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Alpk3Q924C5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Alpk3Q924C5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Alpk3Q924C5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Alpk3Q924C5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Alpk3Q924C5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Alpk3Q924C5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Alpk3Q924C5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Alpk3Q924C5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Alpk3Q924C5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Alpk3Q924C5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Alpk3Q924C5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Alpk3Q924C5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Alpk3Q924C5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Alpk3Q924C5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Alpk3Q924C5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Alpk3Q924C5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Alpk3Q924C5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Alpk3Q924C5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Alpk3Q924C5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Alpk3Q924C5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Alpk3Q924C5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Alpk3Q924C5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Alpk3Q924C5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Alpk3Q924C5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Alpk3Q924C5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Alpk3Q924C5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Alpk3Q924C5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Alpk3Q924C5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Alpk3Q924C5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Alpk3Q924C5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Alpk3Q924C5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Alpk3Q924C5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Alpk3Q924C5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Alpk3Q924C5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Alpk3Q924C5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Alpk3Q924C5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Alpk3Q924C5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Alpk3Q924C5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Alpk3Q924C5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Alpk3Q924C5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms