Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Slc5a4bQ91ZP4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Slc5a4bQ91ZP4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Slc5a4bQ91ZP4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Slc5a4bQ91ZP4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Slc5a4bQ91ZP4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Slc5a4bQ91ZP4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Slc5a4bQ91ZP4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Slc5a4bQ91ZP4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Slc5a4bQ91ZP4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Slc5a4bQ91ZP4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Slc5a4bQ91ZP4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Slc5a4bQ91ZP4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Slc5a4bQ91ZP4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Slc5a4bQ91ZP4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Slc5a4bQ91ZP4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Slc5a4bQ91ZP4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Slc5a4bQ91ZP4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Slc5a4bQ91ZP4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Slc5a4bQ91ZP4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Slc5a4bQ91ZP4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Slc5a4bQ91ZP4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Slc5a4bQ91ZP4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Slc5a4bQ91ZP4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Slc5a4bQ91ZP4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Slc5a4bQ91ZP4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Slc5a4bQ91ZP4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Slc5a4bQ91ZP4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Slc5a4bQ91ZP4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Slc5a4bQ91ZP4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Slc5a4bQ91ZP4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Slc5a4bQ91ZP4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Slc5a4bQ91ZP4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Slc5a4bQ91ZP4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Slc5a4bQ91ZP4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Slc5a4bQ91ZP4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Slc5a4bQ91ZP4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Slc5a4bQ91ZP4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Slc5a4bQ91ZP4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Slc5a4bQ91ZP4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Slc5a4bQ91ZP4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Slc5a4bQ91ZP4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Slc5a4bQ91ZP4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Slc5a4bQ91ZP4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Slc5a4bQ91ZP4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Slc5a4bQ91ZP4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Slc5a4bQ91ZP4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Slc5a4bQ91ZP4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Slc5a4bQ91ZP4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Slc5a4bQ91ZP4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Slc5a4bQ91ZP4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Slc5a4bQ91ZP4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Slc5a4bQ91ZP4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Slc5a4bQ91ZP4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Slc5a4bQ91ZP4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Slc5a4bQ91ZP4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Slc5a4bQ91ZP4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Slc5a4bQ91ZP4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Slc5a4bQ91ZP4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Slc5a4bQ91ZP4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Slc5a4bQ91ZP4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Slc5a4bQ91ZP4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Slc5a4bQ91ZP4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Slc5a4bQ91ZP4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Slc5a4bQ91ZP4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Slc5a4bQ91ZP4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Slc5a4bQ91ZP4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Slc5a4bQ91ZP4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Slc5a4bQ91ZP4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Slc5a4bQ91ZP4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Slc5a4bQ91ZP4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Slc5a4bQ91ZP4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Slc5a4bQ91ZP4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Slc5a4bQ91ZP4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Slc5a4bQ91ZP4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Slc5a4bQ91ZP4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Slc5a4bQ91ZP4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Slc5a4bQ91ZP4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Slc5a4bQ91ZP4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Slc5a4bQ91ZP4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Slc5a4bQ91ZP4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Slc5a4bQ91ZP4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Slc5a4bQ91ZP4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms