Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lims2Q91XD2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lims2Q91XD2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lims2Q91XD2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lims2Q91XD2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lims2Q91XD2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lims2Q91XD2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lims2Q91XD2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lims2Q91XD2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lims2Q91XD2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lims2Q91XD2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lims2Q91XD2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lims2Q91XD2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lims2Q91XD2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lims2Q91XD2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lims2Q91XD2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lims2Q91XD2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lims2Q91XD2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lims2Q91XD2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lims2Q91XD2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lims2Q91XD2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lims2Q91XD2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lims2Q91XD2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lims2Q91XD2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lims2Q91XD2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lims2Q91XD2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lims2Q91XD2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lims2Q91XD2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lims2Q91XD2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lims2Q91XD2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lims2Q91XD2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lims2Q91XD2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lims2Q91XD2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lims2Q91XD2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lims2Q91XD2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lims2Q91XD2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lims2Q91XD2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lims2Q91XD2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lims2Q91XD2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lims2Q91XD2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lims2Q91XD2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lims2Q91XD2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lims2Q91XD2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lims2Q91XD2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lims2Q91XD2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lims2Q91XD2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lims2Q91XD2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lims2Q91XD2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lims2Q91XD2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lims2Q91XD2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lims2Q91XD2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lims2Q91XD2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lims2Q91XD2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lims2Q91XD2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lims2Q91XD2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lims2Q91XD2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lims2Q91XD2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lims2Q91XD2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lims2Q91XD2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lims2Q91XD2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lims2Q91XD2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lims2Q91XD2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lims2Q91XD2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lims2Q91XD2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lims2Q91XD2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lims2Q91XD2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lims2Q91XD2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lims2Q91XD2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lims2Q91XD2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lims2Q91XD2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Lims2Q91XD2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lims2Q91XD2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lims2Q91XD2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lims2Q91XD2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lims2Q91XD2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lims2Q91XD2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lims2Q91XD2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lims2Q91XD2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lims2Q91XD2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lims2Q91XD2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lims2Q91XD2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lims2Q91XD2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lims2Q91XD2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lims2Q91XD2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lims2Q91XD2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lims2Q91XD2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lims2Q91XD2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lims2Q91XD2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lims2Q91XD2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lims2Q91XD2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lims2Q91XD2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lims2Q91XD2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lims2Q91XD2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lims2Q91XD2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lims2Q91XD2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lims2Q91XD2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lims2Q91XD2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lims2Q91XD2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lims2Q91XD2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lims2Q91XD2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms