Protein–RNA interactions for Protein: Q91X84

Crtc3, CREB-regulated transcription coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crtc3Q91X84 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crtc3Q91X84 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crtc3Q91X84 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crtc3Q91X84 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Crtc3Q91X84 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crtc3Q91X84 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crtc3Q91X84 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crtc3Q91X84 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crtc3Q91X84 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crtc3Q91X84 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crtc3Q91X84 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crtc3Q91X84 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crtc3Q91X84 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crtc3Q91X84 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crtc3Q91X84 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crtc3Q91X84 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crtc3Q91X84 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crtc3Q91X84 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crtc3Q91X84 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crtc3Q91X84 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crtc3Q91X84 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crtc3Q91X84 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Crtc3Q91X84 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crtc3Q91X84 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crtc3Q91X84 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crtc3Q91X84 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crtc3Q91X84 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crtc3Q91X84 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crtc3Q91X84 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Crtc3Q91X84 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crtc3Q91X84 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Crtc3Q91X84 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crtc3Q91X84 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crtc3Q91X84 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crtc3Q91X84 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Crtc3Q91X84 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crtc3Q91X84 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crtc3Q91X84 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crtc3Q91X84 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Crtc3Q91X84 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crtc3Q91X84 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Crtc3Q91X84 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Crtc3Q91X84 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crtc3Q91X84 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crtc3Q91X84 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Crtc3Q91X84 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crtc3Q91X84 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crtc3Q91X84 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crtc3Q91X84 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Crtc3Q91X84 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crtc3Q91X84 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crtc3Q91X84 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Crtc3Q91X84 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crtc3Q91X84 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Crtc3Q91X84 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crtc3Q91X84 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Crtc3Q91X84 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crtc3Q91X84 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Crtc3Q91X84 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Crtc3Q91X84 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crtc3Q91X84 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crtc3Q91X84 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Crtc3Q91X84 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crtc3Q91X84 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Crtc3Q91X84 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Crtc3Q91X84 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Crtc3Q91X84 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crtc3Q91X84 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Crtc3Q91X84 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crtc3Q91X84 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Crtc3Q91X84 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Crtc3Q91X84 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crtc3Q91X84 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crtc3Q91X84 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crtc3Q91X84 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Crtc3Q91X84 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms