Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc58Q8R3Q6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc58Q8R3Q6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc58Q8R3Q6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc58Q8R3Q6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc58Q8R3Q6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc58Q8R3Q6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc58Q8R3Q6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc58Q8R3Q6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc58Q8R3Q6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc58Q8R3Q6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc58Q8R3Q6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc58Q8R3Q6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc58Q8R3Q6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc58Q8R3Q6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc58Q8R3Q6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc58Q8R3Q6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc58Q8R3Q6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc58Q8R3Q6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc58Q8R3Q6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc58Q8R3Q6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc58Q8R3Q6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc58Q8R3Q6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc58Q8R3Q6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc58Q8R3Q6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc58Q8R3Q6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc58Q8R3Q6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc58Q8R3Q6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc58Q8R3Q6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc58Q8R3Q6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc58Q8R3Q6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc58Q8R3Q6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc58Q8R3Q6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc58Q8R3Q6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc58Q8R3Q6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc58Q8R3Q6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc58Q8R3Q6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc58Q8R3Q6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc58Q8R3Q6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc58Q8R3Q6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc58Q8R3Q6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc58Q8R3Q6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc58Q8R3Q6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc58Q8R3Q6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc58Q8R3Q6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc58Q8R3Q6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc58Q8R3Q6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc58Q8R3Q6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc58Q8R3Q6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms