Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r200Q8R281 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r200Q8R281 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r200Q8R281 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r200Q8R281 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r200Q8R281 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r200Q8R281 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r200Q8R281 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r200Q8R281 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r200Q8R281 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r200Q8R281 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r200Q8R281 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r200Q8R281 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r200Q8R281 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r200Q8R281 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r200Q8R281 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r200Q8R281 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r200Q8R281 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r200Q8R281 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r200Q8R281 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r200Q8R281 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r200Q8R281 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r200Q8R281 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r200Q8R281 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r200Q8R281 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r200Q8R281 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r200Q8R281 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r200Q8R281 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r200Q8R281 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r200Q8R281 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r200Q8R281 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r200Q8R281 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r200Q8R281 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r200Q8R281 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r200Q8R281 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r200Q8R281 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Vmn1r200Q8R281 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r200Q8R281 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r200Q8R281 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r200Q8R281 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r200Q8R281 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r200Q8R281 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r200Q8R281 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r200Q8R281 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r200Q8R281 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r200Q8R281 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r200Q8R281 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r200Q8R281 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r200Q8R281 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r200Q8R281 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r200Q8R281 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r200Q8R281 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r200Q8R281 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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