Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K4

Ccdc137, Coiled-coil domain-containing protein 137, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc137Q8R0K4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc137Q8R0K4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc137Q8R0K4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc137Q8R0K4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc137Q8R0K4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc137Q8R0K4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc137Q8R0K4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc137Q8R0K4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc137Q8R0K4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc137Q8R0K4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc137Q8R0K4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc137Q8R0K4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc137Q8R0K4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc137Q8R0K4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc137Q8R0K4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc137Q8R0K4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc137Q8R0K4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc137Q8R0K4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc137Q8R0K4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc137Q8R0K4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc137Q8R0K4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc137Q8R0K4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc137Q8R0K4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc137Q8R0K4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc137Q8R0K4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc137Q8R0K4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc137Q8R0K4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc137Q8R0K4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc137Q8R0K4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc137Q8R0K4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc137Q8R0K4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc137Q8R0K4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc137Q8R0K4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc137Q8R0K4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc137Q8R0K4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc137Q8R0K4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc137Q8R0K4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc137Q8R0K4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc137Q8R0K4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc137Q8R0K4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc137Q8R0K4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc137Q8R0K4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc137Q8R0K4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc137Q8R0K4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc137Q8R0K4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc137Q8R0K4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc137Q8R0K4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc137Q8R0K4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc137Q8R0K4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc137Q8R0K4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc137Q8R0K4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc137Q8R0K4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc137Q8R0K4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc137Q8R0K4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc137Q8R0K4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc137Q8R0K4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc137Q8R0K4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc137Q8R0K4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc137Q8R0K4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc137Q8R0K4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc137Q8R0K4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc137Q8R0K4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc137Q8R0K4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc137Q8R0K4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc137Q8R0K4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc137Q8R0K4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc137Q8R0K4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc137Q8R0K4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc137Q8R0K4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc137Q8R0K4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc137Q8R0K4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc137Q8R0K4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc137Q8R0K4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc137Q8R0K4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc137Q8R0K4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc137Q8R0K4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc137Q8R0K4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc137Q8R0K4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc137Q8R0K4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc137Q8R0K4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc137Q8R0K4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc137Q8R0K4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc137Q8R0K4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc137Q8R0K4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc137Q8R0K4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc137Q8R0K4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc137Q8R0K4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc137Q8R0K4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc137Q8R0K4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc137Q8R0K4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc137Q8R0K4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc137Q8R0K4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc137Q8R0K4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc137Q8R0K4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc137Q8R0K4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc137Q8R0K4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc137Q8R0K4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc137Q8R0K4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc137Q8R0K4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc137Q8R0K4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms