Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Depp1Q8K2F3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Depp1Q8K2F3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Depp1Q8K2F3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Depp1Q8K2F3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Depp1Q8K2F3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Depp1Q8K2F3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Depp1Q8K2F3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Depp1Q8K2F3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Depp1Q8K2F3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Depp1Q8K2F3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Depp1Q8K2F3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Depp1Q8K2F3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Depp1Q8K2F3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Depp1Q8K2F3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Depp1Q8K2F3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Depp1Q8K2F3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Depp1Q8K2F3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Depp1Q8K2F3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Depp1Q8K2F3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Depp1Q8K2F3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Depp1Q8K2F3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Depp1Q8K2F3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Depp1Q8K2F3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Depp1Q8K2F3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Depp1Q8K2F3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Depp1Q8K2F3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Depp1Q8K2F3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Depp1Q8K2F3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Depp1Q8K2F3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Depp1Q8K2F3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Depp1Q8K2F3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Depp1Q8K2F3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Depp1Q8K2F3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Depp1Q8K2F3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Depp1Q8K2F3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Depp1Q8K2F3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Depp1Q8K2F3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Depp1Q8K2F3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Depp1Q8K2F3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Depp1Q8K2F3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Depp1Q8K2F3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Depp1Q8K2F3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Depp1Q8K2F3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Depp1Q8K2F3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Depp1Q8K2F3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Depp1Q8K2F3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Depp1Q8K2F3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Depp1Q8K2F3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Depp1Q8K2F3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Depp1Q8K2F3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Depp1Q8K2F3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Depp1Q8K2F3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Depp1Q8K2F3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Depp1Q8K2F3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Depp1Q8K2F3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Depp1Q8K2F3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Depp1Q8K2F3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Depp1Q8K2F3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Depp1Q8K2F3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Depp1Q8K2F3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Depp1Q8K2F3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Depp1Q8K2F3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Depp1Q8K2F3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Depp1Q8K2F3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Depp1Q8K2F3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Depp1Q8K2F3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Depp1Q8K2F3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Depp1Q8K2F3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Depp1Q8K2F3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Depp1Q8K2F3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Depp1Q8K2F3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Depp1Q8K2F3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Depp1Q8K2F3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Depp1Q8K2F3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Depp1Q8K2F3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Depp1Q8K2F3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Depp1Q8K2F3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Depp1Q8K2F3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Depp1Q8K2F3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Depp1Q8K2F3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Depp1Q8K2F3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Depp1Q8K2F3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Depp1Q8K2F3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Depp1Q8K2F3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Depp1Q8K2F3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Depp1Q8K2F3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Depp1Q8K2F3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Depp1Q8K2F3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Depp1Q8K2F3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Depp1Q8K2F3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Depp1Q8K2F3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Depp1Q8K2F3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Depp1Q8K2F3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Depp1Q8K2F3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Depp1Q8K2F3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Depp1Q8K2F3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Depp1Q8K2F3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Depp1Q8K2F3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Depp1Q8K2F3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms