Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim68Q8K243 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim68Q8K243 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim68Q8K243 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim68Q8K243 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim68Q8K243 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim68Q8K243 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim68Q8K243 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim68Q8K243 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trim68Q8K243 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim68Q8K243 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim68Q8K243 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim68Q8K243 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim68Q8K243 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim68Q8K243 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim68Q8K243 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim68Q8K243 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim68Q8K243 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim68Q8K243 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim68Q8K243 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim68Q8K243 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim68Q8K243 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim68Q8K243 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim68Q8K243 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim68Q8K243 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim68Q8K243 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim68Q8K243 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim68Q8K243 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim68Q8K243 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim68Q8K243 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim68Q8K243 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim68Q8K243 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim68Q8K243 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim68Q8K243 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim68Q8K243 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim68Q8K243 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim68Q8K243 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim68Q8K243 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim68Q8K243 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim68Q8K243 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim68Q8K243 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim68Q8K243 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim68Q8K243 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim68Q8K243 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim68Q8K243 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim68Q8K243 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim68Q8K243 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim68Q8K243 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim68Q8K243 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim68Q8K243 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim68Q8K243 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim68Q8K243 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim68Q8K243 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim68Q8K243 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim68Q8K243 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim68Q8K243 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim68Q8K243 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim68Q8K243 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim68Q8K243 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim68Q8K243 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim68Q8K243 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim68Q8K243 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim68Q8K243 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim68Q8K243 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim68Q8K243 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trim68Q8K243 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim68Q8K243 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
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