Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx5Q8K1E0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx5Q8K1E0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx5Q8K1E0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx5Q8K1E0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx5Q8K1E0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx5Q8K1E0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx5Q8K1E0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx5Q8K1E0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx5Q8K1E0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx5Q8K1E0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx5Q8K1E0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx5Q8K1E0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx5Q8K1E0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx5Q8K1E0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx5Q8K1E0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx5Q8K1E0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx5Q8K1E0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx5Q8K1E0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx5Q8K1E0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx5Q8K1E0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx5Q8K1E0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx5Q8K1E0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx5Q8K1E0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx5Q8K1E0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx5Q8K1E0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx5Q8K1E0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx5Q8K1E0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx5Q8K1E0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx5Q8K1E0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx5Q8K1E0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx5Q8K1E0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx5Q8K1E0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx5Q8K1E0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx5Q8K1E0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx5Q8K1E0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx5Q8K1E0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx5Q8K1E0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx5Q8K1E0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx5Q8K1E0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx5Q8K1E0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx5Q8K1E0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx5Q8K1E0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx5Q8K1E0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx5Q8K1E0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stx5Q8K1E0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stx5Q8K1E0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stx5Q8K1E0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stx5Q8K1E0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx5Q8K1E0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx5Q8K1E0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms