Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700001C19RikQ8K168 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
1700001C19RikQ8K168 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700001C19RikQ8K168 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700001C19RikQ8K168 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700001C19RikQ8K168 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700001C19RikQ8K168 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700001C19RikQ8K168 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700001C19RikQ8K168 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700001C19RikQ8K168 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700001C19RikQ8K168 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700001C19RikQ8K168 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700001C19RikQ8K168 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700001C19RikQ8K168 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700001C19RikQ8K168 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700001C19RikQ8K168 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700001C19RikQ8K168 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700001C19RikQ8K168 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
1700001C19RikQ8K168 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700001C19RikQ8K168 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700001C19RikQ8K168 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700001C19RikQ8K168 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700001C19RikQ8K168 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700001C19RikQ8K168 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700001C19RikQ8K168 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700001C19RikQ8K168 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700001C19RikQ8K168 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700001C19RikQ8K168 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700001C19RikQ8K168 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700001C19RikQ8K168 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
1700001C19RikQ8K168 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700001C19RikQ8K168 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700001C19RikQ8K168 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
1700001C19RikQ8K168 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700001C19RikQ8K168 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700001C19RikQ8K168 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
1700001C19RikQ8K168 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700001C19RikQ8K168 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700001C19RikQ8K168 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700001C19RikQ8K168 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700001C19RikQ8K168 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700001C19RikQ8K168 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700001C19RikQ8K168 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700001C19RikQ8K168 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700001C19RikQ8K168 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700001C19RikQ8K168 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700001C19RikQ8K168 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700001C19RikQ8K168 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700001C19RikQ8K168 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700001C19RikQ8K168 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700001C19RikQ8K168 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700001C19RikQ8K168 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700001C19RikQ8K168 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700001C19RikQ8K168 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700001C19RikQ8K168 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700001C19RikQ8K168 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700001C19RikQ8K168 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700001C19RikQ8K168 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700001C19RikQ8K168 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700001C19RikQ8K168 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700001C19RikQ8K168 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
1700001C19RikQ8K168 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700001C19RikQ8K168 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700001C19RikQ8K168 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700001C19RikQ8K168 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700001C19RikQ8K168 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700001C19RikQ8K168 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700001C19RikQ8K168 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700001C19RikQ8K168 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700001C19RikQ8K168 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700001C19RikQ8K168 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700001C19RikQ8K168 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700001C19RikQ8K168 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700001C19RikQ8K168 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700001C19RikQ8K168 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700001C19RikQ8K168 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700001C19RikQ8K168 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
1700001C19RikQ8K168 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700001C19RikQ8K168 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700001C19RikQ8K168 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700001C19RikQ8K168 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700001C19RikQ8K168 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700001C19RikQ8K168 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700001C19RikQ8K168 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700001C19RikQ8K168 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700001C19RikQ8K168 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700001C19RikQ8K168 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700001C19RikQ8K168 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700001C19RikQ8K168 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700001C19RikQ8K168 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700001C19RikQ8K168 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
1700001C19RikQ8K168 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
1700001C19RikQ8K168 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700001C19RikQ8K168 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700001C19RikQ8K168 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700001C19RikQ8K168 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700001C19RikQ8K168 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms